不再怕假阴性，新冠病毒检测灵敏度提高100倍！

赵敏 0 2021-07-02

点赞 0 收藏

分享到

新冠病毒检测灵敏度

波恩大学医院(UKB)开发的创新检测方法：LAMP-Seq为许多人定期检测SARS-CoV-2病毒提供了可能性。通过这种方法，可以在早期发现感染，相应的感染链可以迅速中断。

新型检测蓝染拭子材料在测序装置中进行分析

图片来源:Felix Heyder /波恩大学

波恩大学开发了一种新的新冠病毒检测方法可以使用测序技术同时分析大量拭子，并且具有高灵敏度，能检测出低剂量的病毒，这种创新的方法提供了巨大的潜力。

这一研究结果发表在Nature Biotechnology杂志上。

除接种疫苗外，为了有效监测和控制冠状病毒大流行期间的感染传播，对人群进行系统检测仍然具有关键重要性。只有这样，才能通过有针对性的措施有效监测和遏制病毒的传播。

“LAMP-Seq比当前快速抗原检测检测低数量病毒灵敏度提高了100倍，是常见qPCR测试中灵敏度最高的检测方法，”Jonathan Schmid-Burgk教授说。

除此之外，LAMP-Seq还具有高可扩展性。Schmid-Burgk说，LAMP-Seq方法不仅能检测原始SARS-CoV-2病毒的感染，还能检测与α到δ相关的新变体。

对于“LAMP- seq”测试方法，波恩科学家采用了已经确立的LAMP方法(“环介导等温扩增”——在恒温下传播病毒基因组)，并使其与用于生物医学研究的测序机器兼容。

LAMP技术自2000年出现以来，以其快速、精确、高效的特性已经被广泛的应用。这项技术已经发展到商业化的检测试剂盒中，包括细菌和病毒的检测；这项技术由于其成本低，能够应用于发展中国家的基层的中。

环介导等温扩增

环介导等温扩增（Loop-Mediated Isothermal Amplification，LAMP）技术是日本学者Notomi T于2000年发明的一种新的DNA扩增技术，该方法能够高效、特异、快速的在等温条件下完成。

通过一系列的链置换扩增反应在1h内就可以将靶基因扩增10⁹倍，当靶基因为RNA时，该方法还可以通过在反应体系中添加反转录酶而实现对RNA的扩增；在LAMP反应中，会有大量的DNA合成，因此会产生很多焦磷酸根离子，这些焦磷酸根离子可以结合溶液中的二价Mg²⁺形成不溶的焦磷酸盐，便于对反应结果的观测，使扩增和检测一步就可以完成，大大提高检测效率。

扩增原理

LAMP 技术扩增反应的具体过程比较复杂。

启动阶段

在启动阶段，双链DNA 模板在等温（ 60～65 ℃）的条件下，引物和DNA模板进行结合，在Bst聚合酶的作用下，启动链置换反应，产生一条双链DNA和一条单链DNA。单链DNA形成环状结构。

循环扩增阶段

环状结构形成一种茎-环结构作为LAMP反应中循环反应的起始结构，进入LAMP反应的循环扩增阶段。在循环扩增阶段，茎环结构进而形成哑铃环结构、花椰菜状结构，使产物的序列不断延伸、环化、再延伸，最终的产物是一些具有不同茎长度茎环结构的DNA 和带有许多环的类似花椰菜结构的DNA 的混合物。